Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3BQ9P1U1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms