Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms