Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFDQ9GZP0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms