Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms