Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms