Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC11Q9BVV2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms