Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRB3Q9BUF7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms