Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC22CQ9BRL7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SEC22CQ9BRL7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SEC22CQ9BRL7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC22CQ9BRL7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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