Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms