Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms