Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LYSTQ99698 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms