Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms