Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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