Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms