Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SGF29Q96ES7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SGF29Q96ES7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SGF29Q96ES7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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