Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms