Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms