Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms