Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms