Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPBAR1Q8TDU6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms