Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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