Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP43Q8NFH3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP43Q8NFH3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms