Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms