Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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