Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARHGEF39Q8N4T4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARHGEF39Q8N4T4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARHGEF39Q8N4T4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARHGEF39Q8N4T4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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