Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC117Q8IWD4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms