Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms