Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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