Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms