Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms