Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLIPQ5VWP3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms