Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms