Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms