Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC92Q53HC0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms