Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms