Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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