Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms