Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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