Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms