Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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