Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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