Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC1A5Q15758 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms