Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHBQ15464 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHBQ15464 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHBQ15464 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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