Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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