Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-10■■■□□ 19
PCBP2Q15366 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-10■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 530.1■■■□□ 2.413e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.213e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.26□□□□□ -1.255e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.645e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 DOCK7-209ENST00000614472 1982 ntTSL 56.26□□□□□ -1.413e-10■■■□□ 19
PCBP2Q15366 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.345e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 223.78■■□□□ 1.43e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.393e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 411.51□□□□□ -0.573e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 25.89□□□□□ -1.473e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.551e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 TRIM25-205ENST00000572021 1555 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 PKP4-211ENST00000481115 884 ntTSL 57.12□□□□□ -1.271e-13■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SRCIN1-216ENST00000621763 5225 ntTSL 217.14■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SRCIN1-218ENST00000622519 5204 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SRCIN1-217ENST00000622190 4635 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.124e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 NFIC-208ENST00000589537 977 ntTSL 215.55■□□□□ 0.084e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.054e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-7■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 SLC9B2-207ENST00000506288 1115 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.333e-14■■■□□ 19
PCBP2Q15366 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.883e-6■■■□□ 19
PCBP2Q15366 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 220.24■□□□□ 0.837e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 212.96□□□□□ -0.347e-8■■■□□ 19
PCBP2Q15366 ATP13A1-204ENST00000467160 2431 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ATP13A1-207ENST00000473243 4729 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ATP13A1-214ENST00000497556 2442 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ATP13A1-205ENST00000469641 4241 ntTSL 210.09□□□□□ -0.791e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 215.76■□□□□ 0.119e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.333e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.313e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-220ENST00000513100 557 ntTSL 414.49□□□□□ -0.093e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-208ENST00000453526 559 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.693e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-205ENST00000446294 2065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.693e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.693e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-201ENST00000257435 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-212ENST00000505864 701 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-215ENST00000508161 475 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-213ENST00000507032 311 ntTSL 59.89□□□□□ -0.833e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-203ENST00000395634 1468 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.933e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-219ENST00000509979 771 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NREP-214ENST00000507742 577 ntTSL 25.2□□□□□ -1.583e-11■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-207ENST00000462749 1089 ntTSL 315.91■□□□□ 0.141e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-204ENST00000418146 742 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-202ENST00000405940 1570 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.051e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EIF2B4-208ENST00000475582 4293 ntTSL 510.09□□□□□ -0.791e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 IPO4-220ENST00000561462 1864 ntTSL 216.02■□□□□ 0.161e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.137e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-9■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-13■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.614e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TERF2-208ENST00000567841 554 ntTSL 48.19□□□□□ -1.14e-12■■■□□ 18.9
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 118.7 ms