Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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