Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
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