Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEA1Q15075 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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