Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms