Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IHHQ14623 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms